1. 組織消化
1.1. 按小鼠數(shù)量配制組織消化液,試劑比例如下:
|
單樣本 |
| Protease Plus |
2 μL |
| Buffer L |
100 μL |
組織消化液現(xiàn)用現(xiàn)配,充分混勻后使用。
1.2. 向每個含有樣本的EP管中加入100 μL新鮮組織消化液,55℃水浴/金屬浴中消化15 min。組織消化時,務(wù)必將組織完全浸沒于消化液中。消 化完成后,組織外觀上仍然完整,但足量的基因組DNA已經(jīng)釋放,不影響后續(xù)的PCR實驗。
1.3. 將樣本置于95℃水浴/金屬浴中孵育5 min以滅活消化液中的蛋白酶活性。12000 rpm離心5分鐘,取上清作為PCR模板。消化后的上清或連同組織的消化液可于-20℃保存三個月。
2. PCR擴增
2.1. PCR反應(yīng)體系:
反應(yīng)體系的配制最好于低溫環(huán)境下(如冰浴)完成,以保證PCR擴增效率和擴增特異性。
| PCR 反應(yīng)組分 |
20 μL 反應(yīng)體系 (μL) |
50 μL 反應(yīng)體系 (μL) |
| ddH2O |
8 |
21 |
| 正向引物 (10 μM) |
0.5 |
1 |
| 反向引物 (10 μM) |
0.5 |
1 |
| 模板(消化產(chǎn)物) |
1 |
2 |
| 2 x M-PCR OPTI Mix |
10 |
25 |
注:模板體積可以適當調(diào)整。
2.2. PCR反應(yīng)條件:
| 溫度 (℃) |
時間 |
循環(huán)數(shù) |
| 94 |
5 min |
1 |
| 94 |
20 sec |
35 |
| 50-65 |
30 sec |
| 72 |
X min (2 kb /min) |
| 72 |
5 min |
1 |
| 12 |
-- |
1 |
PCR產(chǎn)物的3’端帶有堿基A,可直接克隆至T載體,用于DNA測序。
3. 瓊脂糖凝膠電泳
試劑2 x M-PCR OPTITM Mix中含有溴酚藍染料,PCR產(chǎn)物可直接點樣進行瓊脂糖凝膠電泳。